Dört ince zarif fil ayak üzerine kurulu kubbeler sistemi yarım kubbeler, küçük kubbeler ve ana kubbe ile tamamlanmış; kubbeleri taşıyan kemerler yeşil taştan; kubbeler ise sarı taştan yapılmıştır. Kubbe içi süslemelerde boya yerine renkli taşlar kullanılmış,pencere kemerlerinde de boya kullanılmayarak süslemeler renkli taşlarla yapılmıştır.
Kubbe içi süslemeler renkli taşlarla yapılırken ilk kez bu caminin kubbe örgüsü de taştan yapıldı.
Yarım kubbeler de sarı taştan örüldü.
Fil ayaklar; ince, zarif ve camide az yer kaplaması esasına dayalı yapılmıştır.
Küçük kubbeler sarı taştan örülürken işlemeleri de renkli taşlarla yapıldı.
Duvar yazıları da boyama yerine yeşil taş oyularak yapılırken hattın üzerine yaldız geçildi. Göbeklerdeki mukarnaslar da alçı yerine sarı taş oyularak yapıldı.
Ana kubbe işlemeleri renkli taşlar kakma usulüyle yapıldı.
Pencere kemerlerinde ve kubbe içi süslemelerde de renkli taşlar kullanıldı.
Örümceği uzaklaştırması için de devekuşu yumurtası yerleştirmeyi ihmal etmediler.
Ayetler yeşil taşa oyuldu.
6 köşeli yıldız figürünün işlendiği bu işlemede evrenin 6 günde yaratıldığı fikri vurgulanmıştır.
Osmanlı camilerinde olmayan üst kat bu camide yapılmıştır.
Kemerlerin ayrıldığı göğüslerdeki bu işleme; taş oyularak yapılmıştır. İşlemede evrenin genişlemeye devam ettiği fikri yansıtılmıştır.
Üst katı taşıyan sütunlar mermerden kemerler yeşil taş ve sarı taştan yapılırken tavan da taştan yapılmıştır.